More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4164 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
205 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  75.86 
 
 
204 aa  311  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  71.64 
 
 
207 aa  291  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  65.2 
 
 
209 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  61.69 
 
 
574 aa  253  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  67.01 
 
 
204 aa  244  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  61.54 
 
 
208 aa  243  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  60.78 
 
 
210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  59.5 
 
 
205 aa  234  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  59.31 
 
 
202 aa  232  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  57.49 
 
 
213 aa  229  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  61.69 
 
 
207 aa  224  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.79 
 
 
208 aa  222  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  54.46 
 
 
208 aa  222  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.98 
 
 
218 aa  221  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  54.19 
 
 
206 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  54.19 
 
 
210 aa  218  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  54.87 
 
 
210 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  55.94 
 
 
202 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  54.87 
 
 
210 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  54.87 
 
 
210 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  54.87 
 
 
209 aa  215  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  54.36 
 
 
209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  53.47 
 
 
206 aa  214  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  54.19 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  53.77 
 
 
211 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  55.94 
 
 
215 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.45 
 
 
228 aa  201  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  52.4 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  54.97 
 
 
211 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  47.42 
 
 
209 aa  154  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  41.09 
 
 
235 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  43.35 
 
 
238 aa  141  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  36.11 
 
 
235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  40.31 
 
 
339 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  38.14 
 
 
275 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  42.02 
 
 
209 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.2 
 
 
211 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  39.29 
 
 
219 aa  118  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  39.15 
 
 
201 aa  118  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  40.22 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  40.43 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.38 
 
 
229 aa  111  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.54 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  41.49 
 
 
209 aa  111  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  36.1 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  39.27 
 
 
209 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  39.68 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 
210 aa  108  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  40.43 
 
 
218 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  37.82 
 
 
218 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  38.83 
 
 
251 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.83 
 
 
205 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 
210 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  37.5 
 
 
213 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  39.89 
 
 
218 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  37.77 
 
 
216 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 
210 aa  105  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  31.96 
 
 
212 aa  105  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  42.05 
 
 
207 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  37.89 
 
 
217 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  31.09 
 
 
209 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  31.09 
 
 
209 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.17 
 
 
205 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  31.12 
 
 
209 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 
222 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 
209 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  32.98 
 
 
208 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  38.3 
 
 
209 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  32.98 
 
 
208 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 
210 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 
212 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  39.39 
 
 
213 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  38.25 
 
 
201 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
218 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  30.61 
 
 
209 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 
214 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  30.61 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  31.77 
 
 
209 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  35.11 
 
 
232 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  35.98 
 
 
217 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 
212 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 
208 aa  99  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  34.2 
 
 
209 aa  98.6  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  37.11 
 
 
218 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  35.98 
 
 
205 aa  97.8  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 
213 aa  97.8  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  38.55 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 
215 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  38.2 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  39.89 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  29.59 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  29.59 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>