More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15320 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 
204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  75.86 
 
 
205 aa  311  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  73.5 
 
 
207 aa  292  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  70.3 
 
 
209 aa  281  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  66.83 
 
 
208 aa  256  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  64.18 
 
 
210 aa  257  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  63.96 
 
 
574 aa  254  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  62.87 
 
 
202 aa  249  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  64.71 
 
 
204 aa  248  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  63.94 
 
 
213 aa  248  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  61.88 
 
 
202 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  61.31 
 
 
205 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  64.82 
 
 
207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  57.43 
 
 
210 aa  232  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  55.94 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  58.62 
 
 
208 aa  232  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  57.79 
 
 
209 aa  227  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  57.29 
 
 
209 aa  226  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  56.67 
 
 
218 aa  225  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  56.06 
 
 
208 aa  223  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  58.21 
 
 
220 aa  220  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  53.96 
 
 
206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  55.78 
 
 
210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  55.78 
 
 
210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  55.78 
 
 
210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  55.34 
 
 
211 aa  214  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.38 
 
 
228 aa  207  9e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  54.95 
 
 
215 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  54.19 
 
 
216 aa  204  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  57.22 
 
 
211 aa  201  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  47.06 
 
 
209 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  43.88 
 
 
235 aa  151  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  42.16 
 
 
238 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  37.27 
 
 
235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  38.5 
 
 
339 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  36 
 
 
275 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  39.34 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.04 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  35.6 
 
 
219 aa  111  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  39.89 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.6 
 
 
229 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  37.37 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.6 
 
 
211 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  38.46 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.76 
 
 
214 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  35.26 
 
 
210 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  37.84 
 
 
218 aa  105  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  35.64 
 
 
209 aa  104  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  32.8 
 
 
212 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 
215 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  38.67 
 
 
204 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  39.77 
 
 
206 aa  102  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  37.91 
 
 
201 aa  102  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 
213 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  38.95 
 
 
204 aa  101  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.79 
 
 
205 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  38.42 
 
 
205 aa  101  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 
251 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  36.02 
 
 
232 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  37.77 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  37.43 
 
 
211 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  36.7 
 
 
218 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  38.3 
 
 
222 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
210 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.65 
 
 
205 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  29.95 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  36.7 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  35.33 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  30.05 
 
 
208 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  30.05 
 
 
208 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  34.92 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
209 aa  98.6  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  36.56 
 
 
216 aa  98.6  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  33.67 
 
 
217 aa  97.8  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  29.38 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  29.38 
 
 
209 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.55 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  34.36 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  36.31 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 
209 aa  96.3  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  36.17 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 
215 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  34.03 
 
 
210 aa  94.7  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  37.77 
 
 
229 aa  94.7  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  34.03 
 
 
205 aa  94  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  36.56 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  35.86 
 
 
213 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  38.12 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>