More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3134 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  62.67 
 
 
217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  62.67 
 
 
217 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  62.27 
 
 
225 aa  268  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  59.45 
 
 
229 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  59.55 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  59.28 
 
 
221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  62.07 
 
 
203 aa  250  9.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  59.72 
 
 
222 aa  248  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  59.11 
 
 
230 aa  246  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  58.33 
 
 
221 aa  243  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  57.6 
 
 
232 aa  241  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  57.34 
 
 
214 aa  241  9e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  58.53 
 
 
218 aa  241  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  57.8 
 
 
218 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  55.45 
 
 
224 aa  236  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  56.42 
 
 
213 aa  234  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  51.14 
 
 
226 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  51.82 
 
 
225 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  51.82 
 
 
225 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  51.36 
 
 
225 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  49.53 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.07 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
225 aa  191  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
225 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  48.58 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  53.06 
 
 
205 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  51.36 
 
 
264 aa  184  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  51.24 
 
 
204 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.5 
 
 
231 aa  173  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  42.56 
 
 
238 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.79 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  46.08 
 
 
226 aa  161  7e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  47.83 
 
 
202 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  36.71 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  40.43 
 
 
195 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  38.34 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  36.22 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  39.58 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.42 
 
 
214 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  36.6 
 
 
208 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.85 
 
 
207 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.36 
 
 
211 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  37.77 
 
 
205 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.16 
 
 
208 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 
205 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
251 aa  101  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  33.84 
 
 
209 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 
206 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 
210 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.65 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 
215 aa  99  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 
207 aa  99  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.63 
 
 
207 aa  98.6  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.56 
 
 
204 aa  98.6  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  35.23 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.52 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.65 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  37.76 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  33.79 
 
 
211 aa  94.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 
205 aa  94.7  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  30.99 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.67 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  30.95 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.66 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  33.51 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 
209 aa  92  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  35.83 
 
 
204 aa  92  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  32.99 
 
 
213 aa  91.3  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2055  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.36 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413941  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.94 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  37.57 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  30.52 
 
 
208 aa  89  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  28.37 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.52 
 
 
574 aa  88.2  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.02 
 
 
215 aa  88.2  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  31.94 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
218 aa  85.1  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 
214 aa  85.1  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>