More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15140 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  59.91 
 
 		 217 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  60.78 
 
 		 217 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  57.94 
 
 		 225 aa  255  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  57.38 
 
 		 224 aa  255  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.69 
 
 		 231 aa  251  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  57.45 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  57.33 
 
 		 213 aa  245  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  59.91 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.36 
 
 		 225 aa  244  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  55.36 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  55.16 
 
 		 216 aa  237  9e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  55.36 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.6 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  54.74 
 
 		 214 aa  232  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  53.02 
 
 		 222 aa  229  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  52.52 
 
 		 221 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  56.07 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  51.72 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  56.07 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  55.83 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  56.49 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  55.65 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  54.31 
 
 		 229 aa  222  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  57.08 
 
 		 205 aa  222  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  55 
 
 		 203 aa  221  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  53.45 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  52.36 
 
 		 216 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  50.83 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  55.88 
 
 		 264 aa  208  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  56.05 
 
 		 226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 204 aa  174  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.34 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  40.19 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  43.3 
 
 		 202 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.77 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.07 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 		 210 aa  105  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  38.12 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  37.22 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  36.07 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 		 208 aa  98.6  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 		 210 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  29.96 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  35.87 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 		 211 aa  95.5  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 208 aa  95.1  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.67 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  30.8 
 
 		 201 aa  91.7  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  30.18 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  36.11 
 
 		 205 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.32 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  31.28 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.67 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.36 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.36 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.36 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.36 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.36 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  30.52 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  30.45 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  31.7 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  28.44 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  30.28 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 215 aa  85.5  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.3 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.8 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  29.2 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  29.96 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  29.52 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  30.73 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  35.75 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  29.22 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.69 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>