More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4110 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  39.53 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  41.43 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  37.75 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.98 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  36.36 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.45 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.1 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  35.58 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.1 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  36.23 
 
 		 209 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35.92 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  34.91 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  33.01 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.45 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  35.89 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.41 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  37.06 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  34.83 
 
 		 212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 		 202 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  32.87 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  36.63 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  35.9 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  36.15 
 
 		 204 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1750  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.42 
 
 		 263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022513  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  34.91 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  28.84 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.1 
 
 		 236 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.18 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.18 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.18 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.37 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.18 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.18 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  35.08 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.95 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  35.78 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  34.41 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 		 213 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  32.72 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  34.54 
 
 		 344 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  35.96 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  31.75 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3108  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2055  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.57 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413941  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  30.09 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.37 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  36.63 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  36.87 
 
 		 361 aa  105  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  35.15 
 
 		 346 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  32.99 
 
 		 346 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 		 213 aa  105  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  36.06 
 
 		 464 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  32.38 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  31.19 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  30.09 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1662  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.220652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  30.09 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  29.33 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  35.03 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  36.51 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  33.16 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  30.69 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>