More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5619 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 218 aa  435  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  66.67 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  65.9 
 
 		 232 aa  274  8e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  63.89 
 
 		 217 aa  268  7e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  62.56 
 
 		 221 aa  266  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  62.96 
 
 		 217 aa  265  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  59.72 
 
 		 214 aa  254  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  60.19 
 
 		 218 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  61.57 
 
 		 213 aa  251  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  58.3 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  62.75 
 
 		 203 aa  241  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  58.53 
 
 		 216 aa  241  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.92 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  57.87 
 
 		 229 aa  238  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  58.22 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  57.66 
 
 		 224 aa  237  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  55.91 
 
 		 226 aa  224  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  53.46 
 
 		 221 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.36 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  54.3 
 
 		 225 aa  211  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  52.86 
 
 		 216 aa  211  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  54.3 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  54.3 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  50.94 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  55.78 
 
 		 205 aa  208  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50.22 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  52.49 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  51.58 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  54.5 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  53.39 
 
 		 264 aa  192  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  51.47 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.93 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50.23 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  44.39 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  39.11 
 
 		 195 aa  138  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  38.42 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.01 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  38.22 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  37.17 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.18 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.84 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.27 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  35.02 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  34.01 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.83 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  32.85 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  35.6 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  31.22 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  35.78 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.6 
 
 		 258 aa  85.9  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  32.52 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  36.24 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  37.36 
 
 		 248 aa  85.1  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  35.79 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 		 574 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  31.22 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  34.9 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.64 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  34.22 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  27.57 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  36.45 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  33.68 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.81 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  32.57 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  30.54 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.98 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  35.94 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.29 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  29.5 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  32.51 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>