More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5067 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  79.63 
 
 		 216 aa  348  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  58.94 
 
 		 208 aa  245  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  61.84 
 
 		 205 aa  244  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  56.48 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  60.48 
 
 		 207 aa  234  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  58.37 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  57.75 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  57.75 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  57.75 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  56.19 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  55.92 
 
 		 209 aa  226  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  57.44 
 
 		 206 aa  224  9e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  54.81 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  54.5 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  59.09 
 
 		 204 aa  222  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  58.16 
 
 		 202 aa  221  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.66 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  53.54 
 
 		 206 aa  215  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  54.33 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  51.42 
 
 		 210 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  51.4 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  53.33 
 
 		 228 aa  207  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.95 
 
 		 204 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  55.94 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  53.88 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  53.17 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  55.61 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  54.59 
 
 		 202 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  47.32 
 
 		 574 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  43.63 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  38.67 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  41.18 
 
 		 238 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  41.62 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  44.74 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  37.38 
 
 		 275 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  37.56 
 
 		 339 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.58 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  34.87 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  38.62 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.79 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  37.37 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.98 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 		 216 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  37.77 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.15 
 
 		 214 aa  98.6  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.46 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  36.22 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  34.9 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  35.08 
 
 		 222 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 		 201 aa  94.7  9e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  37.11 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  37.24 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  34.92 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.32 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  34.9 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.92 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  36.73 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  36.73 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.26 
 
 		 218 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  32.24 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  34.72 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.68 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.68 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  33.33 
 
 		 217 aa  91.3  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.68 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.75 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.68 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.68 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  34.59 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 		 225 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  36.6 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  34.45 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  33.17 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  31.69 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  36.46 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  34.2 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  34.2 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>