More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2551 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  100 
 
 		 209 aa  413  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  56.73 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  51.76 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  50.78 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  52.31 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.45 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  49.75 
 
 		 207 aa  167  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  48.24 
 
 		 205 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  44.9 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.5 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  46.99 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  46.99 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  46.99 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  41.79 
 
 		 218 aa  157  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  46.77 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  42.56 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  42.41 
 
 		 209 aa  154  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  43.98 
 
 		 209 aa  154  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  41.12 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  44.04 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  42.49 
 
 		 574 aa  149  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  42.93 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  44.39 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  42.19 
 
 		 211 aa  147  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  42.93 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  43.08 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  41.21 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  41.88 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  41.62 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  41.53 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  43.46 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  42.42 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  40.74 
 
 		 220 aa  131  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.41 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  34.87 
 
 		 339 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  35.57 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  33.93 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  36.69 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 		 251 aa  95.5  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  32.8 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  32.8 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 		 212 aa  94.7  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.69 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  33.7 
 
 		 209 aa  91.3  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  35.6 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  35.98 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.09 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.11 
 
 		 201 aa  88.2  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  37.43 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  32.78 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 258 aa  85.1  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  35.4 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  31.35 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  36.87 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.72 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  34.84 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  34.22 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  29.69 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  32.79 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  32.28 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  29.32 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  29.32 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  34.22 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  28.73 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  30.69 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.05 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  34.04 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  28.65 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  32.39 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  28.65 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  33.13 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 220 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  28.34 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  28.34 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.26 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  31.35 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  36.31 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>