More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1043 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
235 aa  490  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  64.5 
 
 
237 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  45.78 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  35.92 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3108  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 
233 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.98 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  37.27 
 
 
220 aa  132  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  35.78 
 
 
207 aa  126  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  39.09 
 
 
237 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  40.3 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  37.06 
 
 
237 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 
202 aa  122  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 
238 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.41 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  34.62 
 
 
238 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
238 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
238 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  35.51 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 
213 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  32.85 
 
 
217 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 
203 aa  106  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  30.88 
 
 
209 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 
206 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 
212 aa  102  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  33.66 
 
 
205 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.81 
 
 
211 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 
212 aa  101  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 
226 aa  101  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  31.25 
 
 
205 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.6 
 
 
361 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  32.2 
 
 
232 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
220 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  34.56 
 
 
211 aa  99.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  31.37 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  30.3 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  29.03 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  30.1 
 
 
209 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 
210 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 
205 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.18 
 
 
218 aa  98.2  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 
216 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  34.97 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  32.99 
 
 
354 aa  96.7  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 
209 aa  96.3  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 
210 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.52 
 
 
214 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 
208 aa  95.9  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  30.74 
 
 
308 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 
470 aa  95.5  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  31.5 
 
 
299 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
205 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  29.77 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 
206 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.16 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  29.27 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 
210 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.66 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  28.29 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.98 
 
 
256 aa  93.6  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  29.03 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  32.04 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  31.66 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  31.31 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
217 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  29.61 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  31.78 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  31.75 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.01 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 
204 aa  92.4  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.01 
 
 
260 aa  92.4  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  29.08 
 
 
345 aa  92  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
218 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  31.98 
 
 
233 aa  92  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.34 
 
 
256 aa  91.7  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02510  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.33 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115534  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  28.91 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  30.39 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 
288 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.11 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  28.92 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  34.58 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.93 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 
344 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 
209 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  29.13 
 
 
288 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>