More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2646 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 344 aa  705    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  74.64 
 
 		 345 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  72.3 
 
 		 346 aa  524  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  71.43 
 
 		 346 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  60 
 
 		 233 aa  286  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  60 
 
 		 233 aa  286  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  58.95 
 
 		 233 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  40.5 
 
 		 361 aa  256  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  50.65 
 
 		 235 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  42.18 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  50.22 
 
 		 235 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  42.74 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  42.54 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  42.74 
 
 		 356 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  42.18 
 
 		 356 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  42.18 
 
 		 356 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  41.62 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  50.88 
 
 		 232 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  49.12 
 
 		 230 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  49.12 
 
 		 230 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  50 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  38.29 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.72 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  48.67 
 
 		 242 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  47.79 
 
 		 229 aa  216  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  46.9 
 
 		 249 aa  212  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  47.32 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  47.84 
 
 		 258 aa  210  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  46.81 
 
 		 250 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  44.07 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  46.9 
 
 		 230 aa  209  6e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  44.78 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  49.12 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  46.06 
 
 		 245 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  48.44 
 
 		 229 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  38.19 
 
 		 346 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  48.44 
 
 		 229 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  45.26 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  42.8 
 
 		 250 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  44.83 
 
 		 249 aa  199  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  46.12 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  44.26 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  40.65 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  44.26 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  43.36 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  47.35 
 
 		 239 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  43.56 
 
 		 228 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  45.54 
 
 		 229 aa  183  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  33.82 
 
 		 354 aa  179  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 		 246 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 202 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  33.74 
 
 		 244 aa  116  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.35 
 
 		 472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 		 471 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 		 462 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  35.34 
 
 		 390 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 266 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  35.79 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.54 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 		 214 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 		 459 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.97 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  34.63 
 
 		 489 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  34.2 
 
 		 488 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 464 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 		 476 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 		 471 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 		 463 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.8 
 
 		 236 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 		 236 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.86 
 
 		 214 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0544  aminotransferase class V  27.75 
 
 		 761 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  29.81 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 466 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  38.41 
 
 		 186 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.48 
 
 		 209 aa  99.8  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 		 397 aa  99.8  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  38.15 
 
 		 397 aa  99.8  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 451 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  29.63 
 
 		 455 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.45 
 
 		 471 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 		 470 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  30.27 
 
 		 288 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  36 
 
 		 218 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 243 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0566  aminotransferase class V  26.67 
 
 		 771 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  30.81 
 
 		 237 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0128  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.736109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  26.24 
 
 		 457 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.67 
 
 		 211 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>