More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1299 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
237 aa  487  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  64.5 
 
 
235 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  47.34 
 
 
233 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.53 
 
 
226 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3108  beta-lactamase domain-containing protein  38.38 
 
 
233 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
235 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
262 aa  138  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  35.9 
 
 
237 aa  135  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 
238 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  40.11 
 
 
236 aa  132  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  35.92 
 
 
238 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.24 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  35.92 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  35.92 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  39.04 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
214 aa  128  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 
202 aa  123  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  32.5 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 
203 aa  113  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
205 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.49 
 
 
211 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 
206 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.02 
 
 
361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 
211 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  32.23 
 
 
213 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  35.56 
 
 
229 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  31.44 
 
 
232 aa  105  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  38.42 
 
 
214 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.03 
 
 
215 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.65 
 
 
218 aa  104  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  34.52 
 
 
215 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 
215 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 
229 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  31.44 
 
 
229 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.96 
 
 
239 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 
212 aa  102  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 
213 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.77 
 
 
251 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  29.95 
 
 
258 aa  102  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 
214 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  29.35 
 
 
206 aa  101  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  29.35 
 
 
206 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 
209 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 
205 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 
214 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  31.25 
 
 
207 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 
209 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.98 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 
220 aa  99  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 
218 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  34.8 
 
 
218 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 
226 aa  99  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  33.67 
 
 
215 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 
215 aa  99  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  33.67 
 
 
215 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  32.87 
 
 
206 aa  98.6  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.95 
 
 
255 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.36 
 
 
256 aa  98.2  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 
213 aa  98.2  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  29.38 
 
 
345 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  33.67 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  35.47 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  33.67 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  31.36 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  33.67 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  28.84 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  33.67 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  30.66 
 
 
354 aa  96.7  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 
205 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  29.44 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 
204 aa  96.3  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  33.16 
 
 
215 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.7 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.65 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.65 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  31.79 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.65 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.65 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.65 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  31.28 
 
 
233 aa  95.5  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  32.21 
 
 
207 aa  95.1  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.49 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  31.94 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>