More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0179 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
213 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  71.36 
 
 
213 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  68.4 
 
 
226 aa  303  9.000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  65.73 
 
 
213 aa  297  8e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  65.73 
 
 
213 aa  295  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  61.5 
 
 
215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  59.62 
 
 
218 aa  270  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  39.09 
 
 
220 aa  164  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  42.5 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 
214 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 
202 aa  119  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.79 
 
 
205 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 
459 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 
459 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 
459 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  33.66 
 
 
345 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  33.5 
 
 
346 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  35.86 
 
 
470 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 
459 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  36.97 
 
 
459 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 
467 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 
459 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36 
 
 
211 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.25 
 
 
226 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2260  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 
234 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  32.69 
 
 
235 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
244 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  33.17 
 
 
354 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  32.68 
 
 
201 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  34.57 
 
 
229 aa  99  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
471 aa  98.6  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  32.82 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  30 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.11 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  32.27 
 
 
258 aa  97.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  32.04 
 
 
346 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  33.66 
 
 
242 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  28.1 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  32.04 
 
 
346 aa  95.5  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  33.97 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.97 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.87 
 
 
207 aa  94  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.38 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  36.02 
 
 
461 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  33.16 
 
 
209 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  34.72 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  33.51 
 
 
237 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  34.18 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 
617 aa  93.2  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  32.55 
 
 
217 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 
209 aa  92.4  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 
237 aa  91.7  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  33.51 
 
 
249 aa  91.3  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  33.19 
 
 
459 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  33.51 
 
 
249 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 
471 aa  90.9  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.22 
 
 
472 aa  91.3  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  39.19 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  33.97 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  32.6 
 
 
382 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  30.2 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
459 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
470 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  33.18 
 
 
455 aa  88.6  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 
205 aa  89  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.71 
 
 
256 aa  88.6  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2055  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.52 
 
 
263 aa  88.6  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413941  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 
466 aa  88.6  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 
470 aa  88.2  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 
205 aa  88.2  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06840  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12840)  32.75 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39505  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.27 
 
 
471 aa  87.8  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  29.9 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  29.9 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  32.13 
 
 
464 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  34.69 
 
 
233 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 
206 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 
460 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  33.84 
 
 
463 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  34.02 
 
 
249 aa  86.3  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  36.14 
 
 
251 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  29.54 
 
 
432 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  31.37 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  31.03 
 
 
450 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 
444 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>