More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4842 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  100 
 
 		 346 aa  699    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  59.24 
 
 		 354 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  37.08 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  39.6 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  37.82 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  38.38 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  37.9 
 
 		 344 aa  199  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  41.63 
 
 		 235 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  41.63 
 
 		 235 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  38.23 
 
 		 356 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  37.92 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  37.36 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  43.97 
 
 		 233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  43.91 
 
 		 233 aa  182  6e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  35.67 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  37.36 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  37.64 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.33 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  43.56 
 
 		 229 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  43.56 
 
 		 229 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  42.72 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  42.73 
 
 		 239 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  41.63 
 
 		 232 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  40.09 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  39.39 
 
 		 258 aa  158  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  40.71 
 
 		 249 aa  155  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  39.82 
 
 		 242 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  40 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 202 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  37.18 
 
 		 233 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  39.57 
 
 		 250 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  39.57 
 
 		 250 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  35.63 
 
 		 250 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  38.98 
 
 		 248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  36.96 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  35.12 
 
 		 244 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  38.94 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  39.15 
 
 		 229 aa  143  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 		 246 aa  142  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  37.95 
 
 		 245 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  34.96 
 
 		 233 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.86 
 
 		 239 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  37.61 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.48 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  37.61 
 
 		 230 aa  135  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  37.1 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 250 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  30.06 
 
 		 467 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 466 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  29.92 
 
 		 472 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  37.78 
 
 		 244 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  30.27 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 		 232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  38.29 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  36.28 
 
 		 251 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  30.58 
 
 		 467 aa  126  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  37.38 
 
 		 226 aa  125  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 214 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 		 213 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.85 
 
 		 471 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.15 
 
 		 472 aa  123  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  38.89 
 
 		 207 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.5 
 
 		 218 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  27.65 
 
 		 456 aa  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  27.91 
 
 		 457 aa  119  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  38.32 
 
 		 208 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  33 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 471 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 		 213 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.07 
 
 		 211 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  32.78 
 
 		 459 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 		 489 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  37.76 
 
 		 220 aa  116  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.97 
 
 		 471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 		 470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  32.56 
 
 		 464 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 		 459 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 		 459 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  33.22 
 
 		 459 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  28.45 
 
 		 450 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  35.44 
 
 		 215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  33.73 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 		 476 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  36.45 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  37.28 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 243 aa  113  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  32.87 
 
 		 459 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 466 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 		 459 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 		 459 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 		 243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>