More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3771 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  82.87 
 
 		 216 aa  364  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  61.36 
 
 		 226 aa  251  8.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  56.28 
 
 		 231 aa  232  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  51.89 
 
 		 217 aa  214  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  53.49 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  51.42 
 
 		 217 aa  211  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  55.72 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  50.94 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  56.46 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.91 
 
 		 225 aa  207  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.16 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  49.77 
 
 		 221 aa  201  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  51.46 
 
 		 225 aa  201  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  51.89 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  50.94 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  53.62 
 
 		 225 aa  197  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  49.53 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  50.23 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  52.66 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  50 
 
 		 203 aa  195  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  52.17 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  52.17 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50.68 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  51.46 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  51.69 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  53.62 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  49.06 
 
 		 222 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  46.82 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  46.01 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  47.62 
 
 		 218 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50.9 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  49.04 
 
 		 204 aa  175  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  42.03 
 
 		 195 aa  151  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  36.15 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  36.67 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  39.3 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 205 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  37.13 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.15 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  35.85 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.79 
 
 		 218 aa  92.8  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  34.11 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  36.15 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.44 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  30.84 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 209 aa  88.2  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  33.66 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.5 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  35.14 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  34.45 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36 
 
 		 574 aa  84.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.18 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  37.72 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.48 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  28.77 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  30.77 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  30.33 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  33.01 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  27.57 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  27.98 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.96 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  31.22 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  28.85 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  31.96 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  26.64 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  25.59 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  32.12 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  32.46 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  25.37 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  31.9 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  27.01 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>