More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3114 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 217 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  91.24 
 
 		 217 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  69.23 
 
 		 221 aa  292  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  65.14 
 
 		 213 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  63.3 
 
 		 214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  64.35 
 
 		 222 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  63.3 
 
 		 229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  62.67 
 
 		 216 aa  268  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  63.89 
 
 		 218 aa  268  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  66.18 
 
 		 203 aa  266  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  63.43 
 
 		 232 aa  263  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  61.93 
 
 		 218 aa  261  8e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  63.64 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  61.36 
 
 		 225 aa  255  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  60 
 
 		 224 aa  255  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  60.89 
 
 		 230 aa  254  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  58.62 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  57.8 
 
 		 221 aa  229  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  55.25 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.95 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  55.61 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  51.42 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  50.94 
 
 		 216 aa  211  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  54.55 
 
 		 225 aa  208  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  58.67 
 
 		 205 aa  208  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  55 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  55 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  54.55 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.51 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  55 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  49.05 
 
 		 202 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  46.54 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  46.51 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  40.2 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  35.89 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  39.23 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.63 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  37.26 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  37.67 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.41 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.95 
 
 		 229 aa  101  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  32.71 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  37.32 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  33.49 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  35.42 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 		 205 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.38 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 251 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  35.6 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  34.16 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  34.38 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.83 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.67 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  34.27 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.38 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 		 209 aa  88.6  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  32.84 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.71 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.67 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  31.37 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  34.31 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 		 209 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  32.84 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  32.84 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.25 
 
 		 256 aa  85.9  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  32.84 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.87 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  32.84 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  34.54 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>