More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2189 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  71.95 
 
 
214 aa  321  6e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  70.59 
 
 
213 aa  317  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  67.87 
 
 
218 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  68.78 
 
 
229 aa  295  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  69.23 
 
 
217 aa  292  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  66.67 
 
 
222 aa  292  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  70.14 
 
 
217 aa  291  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  65.3 
 
 
232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  67.63 
 
 
203 aa  279  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  62.56 
 
 
218 aa  266  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  64.55 
 
 
221 aa  264  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  63.68 
 
 
225 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  63.39 
 
 
230 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  61.88 
 
 
225 aa  259  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  59.28 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  58.65 
 
 
225 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  54.26 
 
 
224 aa  228  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  56.73 
 
 
225 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  52.94 
 
 
226 aa  224  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  56.73 
 
 
225 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  56.73 
 
 
225 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.45 
 
 
237 aa  222  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  56.73 
 
 
225 aa  221  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  56.56 
 
 
264 aa  218  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.7 
 
 
231 aa  217  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  57.79 
 
 
205 aa  209  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  49.77 
 
 
216 aa  201  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  50.7 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.08 
 
 
238 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  50.5 
 
 
204 aa  178  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50.23 
 
 
226 aa  169  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  49.53 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 
195 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  34.27 
 
 
201 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
217 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.81 
 
 
207 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  39.9 
 
 
218 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  39.9 
 
 
218 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.32 
 
 
211 aa  108  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  38.91 
 
 
218 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 
210 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.85 
 
 
218 aa  105  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.13 
 
 
205 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.27 
 
 
209 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  35.91 
 
 
210 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
205 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
210 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 
205 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  31.94 
 
 
207 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.68 
 
 
228 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  35.33 
 
 
204 aa  98.6  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.77 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.73 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  34.36 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  34.01 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.65 
 
 
226 aa  95.5  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  35.23 
 
 
211 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.88 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.88 
 
 
214 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.63 
 
 
251 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  30.19 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  34.45 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  34.91 
 
 
213 aa  89  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
216 aa  89  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  34.69 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  28.84 
 
 
207 aa  88.2  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  34.87 
 
 
209 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 
214 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  30.92 
 
 
218 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 
201 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 
218 aa  86.3  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  31.34 
 
 
211 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.8 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  32.24 
 
 
218 aa  85.1  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.79 
 
 
208 aa  85.1  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  33.8 
 
 
215 aa  85.1  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 
215 aa  85.1  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 
209 aa  85.1  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  31.96 
 
 
213 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2738  beta-lactamase domain-containing protein  34.05 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2055  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.63 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413941  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  31.03 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>