More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2125 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  78.33 
 
 		 229 aa  324  6e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  67.63 
 
 		 221 aa  279  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  66.67 
 
 		 217 aa  269  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  66.99 
 
 		 225 aa  268  5.9999999999999995e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  66.18 
 
 		 217 aa  266  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  66.67 
 
 		 213 aa  266  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  64.71 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  64.08 
 
 		 225 aa  258  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  62.62 
 
 		 224 aa  254  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  62.07 
 
 		 222 aa  252  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  62.07 
 
 		 216 aa  250  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  63.24 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  62.75 
 
 		 218 aa  241  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  59.71 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  62.75 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  60.29 
 
 		 218 aa  234  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  59.71 
 
 		 225 aa  234  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  59.71 
 
 		 225 aa  234  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  58.74 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  59.22 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  55.88 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  58.02 
 
 		 230 aa  222  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  59.71 
 
 		 264 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  59.18 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.15 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 216 aa  195  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.09 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  49.53 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  53.27 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50.68 
 
 		 238 aa  177  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.07 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  39.8 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  48.21 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.74 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  38 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  38.21 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  39.45 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.61 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  39.45 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35.61 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  38.53 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  35.65 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.45 
 
 		 211 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 		 205 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 		 251 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  36.07 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  36.98 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  38.02 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.25 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  35.08 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.17 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  36.98 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.72 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.16 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.76 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  34.76 
 
 		 215 aa  95.5  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 		 215 aa  95.5  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.13 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  32.67 
 
 		 215 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 		 215 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  32.67 
 
 		 215 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 		 213 aa  94.7  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  31.92 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  30.88 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  30.7 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.56 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  32.67 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  32.18 
 
 		 215 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 		 303 aa  91.3  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2738  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  31.46 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.51 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>