More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0614 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 		 255 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  89.37 
 
 		 255 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  87.4 
 
 		 255 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  72.44 
 
 		 255 aa  400  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  72.05 
 
 		 255 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  72.83 
 
 		 255 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  74.41 
 
 		 255 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.2 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.96 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.54 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.16 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.2 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.59 
 
 		 255 aa  254  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  49 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  48.62 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  49.4 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.6 
 
 		 256 aa  249  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.82 
 
 		 255 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.6 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  47.64 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.64 
 
 		 255 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.8 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.8 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.99 
 
 		 256 aa  241  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  49.79 
 
 		 256 aa  241  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.02 
 
 		 259 aa  239  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  48.18 
 
 		 262 aa  238  5e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.02 
 
 		 259 aa  238  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.38 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.84 
 
 		 278 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.83 
 
 		 258 aa  231  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  46 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  46 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.67 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  47.56 
 
 		 227 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.24 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.67 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.6 
 
 		 260 aa  211  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.55 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  44 
 
 		 272 aa  209  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.29 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.95 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.8 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1432  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.76 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.949505  normal  0.289854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.9 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.62 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.23 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.19 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.19 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.23 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1038  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.23 
 
 		 259 aa  191  7e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.769751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  45.45 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  43.25 
 
 		 252 aa  189  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.71 
 
 		 248 aa  187  9e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  40.56 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  41.04 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.94 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.55 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.63 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.57 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.53 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  40.81 
 
 		 284 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.29 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.39 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.67 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.84 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.63 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.27 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.69 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.92 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.7 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2788  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.32 
 
 		 268 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000589518  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.68 
 
 		 257 aa  178  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.64 
 
 		 263 aa  178  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  40.23 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  44.71 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.64 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.69 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.76 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.02 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.98 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.96 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.02 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.92 
 
 		 252 aa  175  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.66 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.58 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.82 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  40.38 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.64 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.26 
 
 		 266 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.78 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  38.7 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1665  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.64 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.26 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1411  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.38 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>