More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0508 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 		 255 aa  520  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  74.12 
 
 		 255 aa  410  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  74.9 
 
 		 255 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  74.9 
 
 		 255 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  76.47 
 
 		 255 aa  397  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  74.9 
 
 		 255 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  72.83 
 
 		 255 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.78 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.52 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.57 
 
 		 282 aa  268  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.52 
 
 		 256 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.78 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  47.83 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.2 
 
 		 256 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.21 
 
 		 255 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.6 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  47.6 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  48 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.21 
 
 		 256 aa  246  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  46.64 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.21 
 
 		 259 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  49.59 
 
 		 256 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.03 
 
 		 255 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  51 
 
 		 256 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.02 
 
 		 258 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  45.67 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.28 
 
 		 255 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.6 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.64 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.61 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.64 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  46.4 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.4 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.04 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  45.2 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.2 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.31 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  46.7 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.33 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.85 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.89 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.73 
 
 		 242 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.09 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.7 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.75 
 
 		 258 aa  198  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.7 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.02 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  43.87 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.75 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  44.09 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.31 
 
 		 263 aa  191  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  44.57 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  41.6 
 
 		 257 aa  190  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.25 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.25 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.45 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  41.47 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  44.75 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.6 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1432  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.23 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.949505  normal  0.289854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  46.09 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.06 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.96 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.7 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.38 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.8 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.7 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.32 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.97 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.09 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  42.44 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.13 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1038  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.08 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.769751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.91 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.52 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.47 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.09 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.58 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.54 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.47 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.11 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.97 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.23 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.68 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.57 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  38 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.19 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.13 
 
 		 263 aa  175  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.23 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.55 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.92 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1702  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.13 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0461199  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.07 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.86 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.06 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.41 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  38.87 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.86 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.45 
 
 		 279 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.08 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>