More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0956 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0956  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 291 aa  608  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1071  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 244 aa  508  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  42.47 
 
 		 361 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  34.1 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  35.48 
 
 		 229 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 		 229 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  34.18 
 
 		 229 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  35.24 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2821  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 215 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  hitchhiker  0.0000107542 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.7 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  32.98 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  35.64 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 		 232 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 356 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  35.32 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 		 356 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  32 
 
 		 356 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  31.5 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  34.57 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  30.18 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 		 249 aa  102  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  35.52 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 356 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.85 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  32 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 		 230 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  29.91 
 
 		 230 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 		 344 aa  95.5  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  32.09 
 
 		 233 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  33.51 
 
 		 345 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  31.72 
 
 		 233 aa  93.6  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  32.63 
 
 		 233 aa  93.6  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  32.8 
 
 		 346 aa  92  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  31.63 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 202 aa  90.1  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  32.71 
 
 		 250 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  31.18 
 
 		 346 aa  89  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  31.28 
 
 		 250 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  31.19 
 
 		 229 aa  87.8  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  29.11 
 
 		 354 aa  86.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  30.05 
 
 		 235 aa  85.9  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 		 250 aa  85.9  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  29.53 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  31.02 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  28.97 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  27.72 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  30.73 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  32.95 
 
 		 207 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  32.7 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  29.84 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.7 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  25.78 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  27.3 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  30.53 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  35.51 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  29.84 
 
 		 205 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1750  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.02 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022513  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2055  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.45 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413941  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.71 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  30 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  27.81 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.98 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  30.05 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2599  beta-lactamase-like protein  30.93 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.398992  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  29.46 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  24.88 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  29.95 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  27.23 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.39 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 206 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 		 220 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1978  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  29.9 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.74 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>