More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1978 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1978  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 288 aa  598  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  48.07 
 
 		 287 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  46.5 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  45.8 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  44.88 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  48.1 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  47.37 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  44.72 
 
 		 288 aa  262  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  45.33 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  44.96 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  44.98 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2470  beta-lactamase domain-containing protein  45.3 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  44.76 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  44.64 
 
 		 294 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0869  beta-lactamase domain-containing protein  45.83 
 
 		 293 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.158714 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  44.91 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  44.29 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6239  beta-lactamase domain-containing protein  46.29 
 
 		 286 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  44.76 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  43.36 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  44.29 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  43.9 
 
 		 293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3460  Beta-lactamase-like  44.37 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  44.33 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  42.16 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1921  beta-lactamase-like  42.66 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  43.46 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0128  beta-lactamase domain-containing protein  43.21 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.736109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  42.56 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  42.91 
 
 		 294 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  42.91 
 
 		 294 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  42.56 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 		 293 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  42.86 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2599  beta-lactamase-like protein  44.29 
 
 		 307 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.398992  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  44.52 
 
 		 426 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  42.56 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  44.72 
 
 		 296 aa  245  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1544  hypothetical protein  44.21 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  42.12 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  45.2 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  42.91 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  42.2 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3744  beta-lactamase domain-containing protein  42.76 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  44.17 
 
 		 426 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  43.06 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  41.87 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0473  beta-lactamase domain-containing protein  40.21 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  41.46 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  41.46 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  41.7 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  44.72 
 
 		 304 aa  242  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  41.05 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0800  beta-lactamase domain-containing protein  41.78 
 
 		 306 aa  242  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.44102  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  42.96 
 
 		 431 aa  241  7.999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2701  beta-lactamase domain protein  40.71 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.21 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  41.81 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  41.7 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  41.98 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1705  beta-lactamase domain protein  44.21 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.739327 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4706  beta-lactamase domain-containing protein  43.57 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.10936 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  42.25 
 
 		 432 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  42.5 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  43.46 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1299  putative metallo-beta-lactamase family protein  44.01 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2535  beta-lactamase-like  40.56 
 
 		 312 aa  238  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  41.11 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  41.44 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.71 
 
 		 439 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  41.55 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  41.03 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4665  beta-lactamase domain protein  42.45 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168284  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2013  beta-lactamase domain protein  43.51 
 
 		 286 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3366  beta-lactamase-like  42.86 
 
 		 316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4719  beta-lactamase domain-containing protein  43.77 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  43.1 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  39.53 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.52 
 
 		 290 aa  231  9e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6795  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  41.7 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  41.87 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  39.51 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1610  beta-lactamase domain-containing protein  42.51 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0776893  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.06 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  39.06 
 
 		 300 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  39.06 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  39.25 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  42.12 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  39.59 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3688  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  41.72 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2816  beta-lactamase-like  41.55 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104753  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  40.85 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1647  beta-lactamase domain protein  39.04 
 
 		 289 aa  208  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3205  beta-lactamase domain-containing protein  40.42 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.568485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00087  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0946  beta-lactamase-like  35.82 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000101762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02317  beta-lactamase  40.08 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.914825  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  39.1 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>