More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0343 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.71 
 
 
256 aa  310  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.52 
 
 
256 aa  304  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.86 
 
 
278 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.96 
 
 
256 aa  274  8e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.55 
 
 
272 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.94 
 
 
255 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.44 
 
 
256 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.17 
 
 
256 aa  264  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
255 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.75 
 
 
255 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  53.36 
 
 
255 aa  261  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.2 
 
 
260 aa  260  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  49.41 
 
 
255 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  50 
 
 
262 aa  259  3e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.8 
 
 
255 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.41 
 
 
260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  49.41 
 
 
257 aa  258  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  48.41 
 
 
256 aa  254  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.61 
 
 
242 aa  252  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.65 
 
 
246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.39 
 
 
254 aa  252  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.6 
 
 
255 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.8 
 
 
256 aa  248  9e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
256 aa  247  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.6 
 
 
255 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  49.21 
 
 
256 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.64 
 
 
282 aa  241  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.88 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  46 
 
 
255 aa  239  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.82 
 
 
242 aa  237  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.38 
 
 
256 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.95 
 
 
257 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.56 
 
 
257 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.02 
 
 
258 aa  234  8e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  44 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.59 
 
 
248 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.22 
 
 
256 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.45 
 
 
248 aa  224  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  44.79 
 
 
257 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.17 
 
 
257 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.92 
 
 
258 aa  222  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.6 
 
 
255 aa  222  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.91 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.77 
 
 
263 aa  216  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.46 
 
 
258 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.63 
 
 
257 aa  216  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.24 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.15 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  46.74 
 
 
259 aa  211  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.8 
 
 
259 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.42 
 
 
259 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.93 
 
 
266 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  43.49 
 
 
267 aa  209  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.49 
 
 
254 aa  209  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.04 
 
 
259 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.67 
 
 
256 aa  208  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  47.88 
 
 
255 aa  208  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.75 
 
 
255 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.75 
 
 
255 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.04 
 
 
259 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.26 
 
 
263 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.08 
 
 
258 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  45.59 
 
 
284 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.64 
 
 
263 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.67 
 
 
259 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.53 
 
 
264 aa  203  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.94 
 
 
259 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  43.97 
 
 
252 aa  201  7e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.26 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.29 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.26 
 
 
263 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.68 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.83 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.21 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.9 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.29 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.64 
 
 
295 aa  198  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.64 
 
 
295 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  42.01 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  42.64 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.56 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  42.92 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05621  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  39.84 
 
 
253 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  43.01 
 
 
266 aa  194  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.15 
 
 
267 aa  193  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 
257 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  49.55 
 
 
265 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.04 
 
 
258 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.96 
 
 
279 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.46 
 
 
256 aa  191  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.1 
 
 
279 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.86 
 
 
252 aa  191  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.21 
 
 
259 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2021  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.77 
 
 
258 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360558  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.21 
 
 
257 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.06 
 
 
256 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  44.05 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.05 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.54 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>