More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3839 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  86.05 
 
 		 470 aa  833    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  70.18 
 
 		 472 aa  654    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 469 aa  960    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  63.62 
 
 		 502 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  63.44 
 
 		 470 aa  580  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  58.21 
 
 		 479 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  53.45 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  51.39 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  48.34 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  41.31 
 
 		 476 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  42.74 
 
 		 476 aa  350  3e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  39.87 
 
 		 469 aa  348  9e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  41.76 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  38.21 
 
 		 484 aa  342  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  38.21 
 
 		 484 aa  342  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.1 
 
 		 478 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.21 
 
 		 478 aa  339  7e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.21 
 
 		 478 aa  339  7e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.17 
 
 		 478 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  38.01 
 
 		 478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  41.68 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  39.41 
 
 		 464 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  41.96 
 
 		 484 aa  325  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  37.34 
 
 		 478 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  37.92 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  37.92 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  37.12 
 
 		 442 aa  283  6.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  37.26 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  31.13 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  34.79 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 		 459 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  36.11 
 
 		 460 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  34.18 
 
 		 459 aa  233  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  38.01 
 
 		 457 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.04 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 		 459 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 		 459 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  34.39 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  34.81 
 
 		 459 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  34.61 
 
 		 456 aa  217  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  34.99 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 		 466 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  32.12 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.77 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 470 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  31.89 
 
 		 489 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  29.23 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  31.8 
 
 		 450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  34.27 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 		 453 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  30.38 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 		 455 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.47 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 		 450 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.63 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  39.17 
 
 		 488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 		 617 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  38.84 
 
 		 243 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  39.26 
 
 		 243 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  37.92 
 
 		 243 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 		 476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  32.39 
 
 		 470 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  31.97 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 		 454 aa  150  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  39.37 
 
 		 246 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.93 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  39.37 
 
 		 246 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0381  metallo-beta-lactamase family protein  39.37 
 
 		 246 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0424  metallo-beta-lactamase family protein  39.37 
 
 		 246 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  40.53 
 
 		 244 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1757  metallo-beta-lactamase family protein  39.37 
 
 		 246 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1570  metallo-beta-lactamase family protein  39.37 
 
 		 246 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  38.14 
 
 		 244 aa  147  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  30.26 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  35.25 
 
 		 246 aa  145  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.83 
 
 		 243 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 		 451 aa  136  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 		 454 aa  136  9e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 		 480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  36.8 
 
 		 251 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>