More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3034 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
382 aa  767    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1429  Rhodanese domain protein  51.48 
 
 
401 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  47.27 
 
 
391 aa  351  1e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3165  beta-lactamase domain protein  46.82 
 
 
421 aa  350  3e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0596  beta-lactamase domain protein  47.75 
 
 
432 aa  329  4e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0257  beta-lactamase domain protein  43.7 
 
 
397 aa  256  5e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  41.07 
 
 
397 aa  252  6e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3386  beta-lactamase domain protein  39.95 
 
 
428 aa  246  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  40.47 
 
 
390 aa  246  6e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  39.59 
 
 
397 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  39.34 
 
 
400 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  37.82 
 
 
369 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0612  beta-lactamase domain protein  38.21 
 
 
389 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  33.76 
 
 
378 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3284  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 
369 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
375 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  38.83 
 
 
376 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4110  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 
370 aa  193  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0739  metallo-beta-lactamase family protein  35.22 
 
 
376 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0687  metallo-beta-lactamase family protein  35.22 
 
 
376 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.879597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0777  metallo-beta-lactamase family protein  35.22 
 
 
376 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0871  metallo-beta-lactamase family protein  35.22 
 
 
376 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000195083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0687  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 
378 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.596111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2641  beta-lactamase domain protein  37.4 
 
 
379 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0938  metallo-beta-lactamase family protein  34.63 
 
 
376 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0673  metallo-beta-lactamase family protein  34.7 
 
 
376 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00215478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0831  metallo-beta-lactamase family protein  34.96 
 
 
376 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00416077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0867  metallo-beta-lactamase family protein  34.86 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4505  metallo-beta-lactamase family protein  35.22 
 
 
378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000320753 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  37.17 
 
 
374 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1282  rhodanese-like protein  35.04 
 
 
397 aa  176  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2930  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1152  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000210846  decreased coverage  0.000000422487 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1932  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 
403 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516166  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  41.35 
 
 
244 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  39.91 
 
 
251 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.45 
 
 
243 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  35.38 
 
 
457 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  36.19 
 
 
462 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1187  beta-lactamase domain-containing protein  33.07 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  34.77 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0816  beta-lactamase domain-containing protein  33.25 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.71 
 
 
480 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  37.45 
 
 
479 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  33.89 
 
 
244 aa  123  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  34.98 
 
 
472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  35 
 
 
464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 
244 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  35.6 
 
 
243 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 
476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0381  metallo-beta-lactamase family protein  36.65 
 
 
246 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1570  metallo-beta-lactamase family protein  36.65 
 
 
246 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0424  metallo-beta-lactamase family protein  36.65 
 
 
246 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1757  metallo-beta-lactamase family protein  36.65 
 
 
246 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  36.65 
 
 
246 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  36.65 
 
 
246 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 
480 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  32.92 
 
 
455 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.13 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 
476 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
469 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 
243 aa  113  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 
243 aa  113  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 
246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  33.75 
 
 
459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 
459 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  32.68 
 
 
459 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 
459 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 
464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  32.9 
 
 
470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 
488 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  37.23 
 
 
461 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
453 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  31.6 
 
 
463 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  32.59 
 
 
617 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
470 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
471 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 
230 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.7 
 
 
230 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
467 aa  105  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  34.8 
 
 
228 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
469 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  31.89 
 
 
466 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 
471 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 
470 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.86 
 
 
472 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 
489 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  34.76 
 
 
242 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  34.25 
 
 
229 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 
444 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 
467 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 
459 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 
444 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.47 
 
 
471 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  35.63 
 
 
354 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  31.49 
 
 
346 aa  103  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
459 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
459 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  32 
 
 
459 aa  102  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>