More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0612 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0612  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
389 aa  770    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  55.44 
 
 
390 aa  393  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  48.34 
 
 
400 aa  347  3e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0257  beta-lactamase domain protein  49.1 
 
 
397 aa  346  4e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  45.78 
 
 
397 aa  332  7.000000000000001e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3386  beta-lactamase domain protein  43.97 
 
 
428 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  45.9 
 
 
397 aa  328  9e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  38.34 
 
 
374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  38.21 
 
 
382 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0673  metallo-beta-lactamase family protein  34.11 
 
 
376 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00215478  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  37.98 
 
 
376 aa  206  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0831  metallo-beta-lactamase family protein  34.55 
 
 
376 aa  206  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00416077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0739  metallo-beta-lactamase family protein  33.59 
 
 
376 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0687  metallo-beta-lactamase family protein  33.59 
 
 
376 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.879597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0777  metallo-beta-lactamase family protein  33.59 
 
 
376 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0871  metallo-beta-lactamase family protein  33.59 
 
 
376 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000195083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0867  metallo-beta-lactamase family protein  34.29 
 
 
376 aa  202  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1282  rhodanese-like protein  37.16 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0938  metallo-beta-lactamase family protein  33.42 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0687  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.596111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4505  metallo-beta-lactamase family protein  34.81 
 
 
378 aa  195  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000320753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 
375 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4110  Rhodanese domain protein  39.12 
 
 
370 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2641  beta-lactamase domain protein  37.14 
 
 
379 aa  193  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  36.72 
 
 
369 aa  192  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 
391 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1187  beta-lactamase domain-containing protein  33 
 
 
393 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3165  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 
421 aa  176  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 
378 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0596  beta-lactamase domain protein  35.7 
 
 
432 aa  169  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1932  beta-lactamase domain-containing protein  32.75 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516166  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1429  Rhodanese domain protein  32.67 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0816  beta-lactamase domain-containing protein  33.75 
 
 
393 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1152  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 
395 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000210846  decreased coverage  0.000000422487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2930  beta-lactamase domain-containing protein  31.77 
 
 
378 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3284  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 
369 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  39.66 
 
 
459 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  39.66 
 
 
459 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.56 
 
 
243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0540  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.62 
 
 
472 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 
459 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  31.7 
 
 
471 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  37.93 
 
 
459 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 
459 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 
459 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  33.06 
 
 
463 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 
471 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  33.49 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 
244 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 
243 aa  95.9  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 
470 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  36.17 
 
 
243 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.22 
 
 
230 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 
230 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 
467 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 
462 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  35.89 
 
 
464 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  34 
 
 
459 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 
470 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 
466 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 
250 aa  90.5  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  34.04 
 
 
457 aa  90.5  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.73 
 
 
471 aa  89.7  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  27.38 
 
 
244 aa  88.6  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  29.86 
 
 
239 aa  88.2  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 
242 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  30.19 
 
 
233 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  36.04 
 
 
460 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  35.43 
 
 
459 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  34.89 
 
 
243 aa  87.4  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 
461 aa  86.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.32 
 
 
471 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  30.88 
 
 
251 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  30.36 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 
244 aa  84  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  30.4 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  27.95 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  34.19 
 
 
479 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  32.05 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  28.82 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.02 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  32.69 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  32.52 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  29.59 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 
470 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 
444 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  28.24 
 
 
345 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.65 
 
 
502 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  25.32 
 
 
228 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.17 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 
480 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 
480 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  29.03 
 
 
229 aa  75.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  27.82 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>