More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3248 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3248  rhodanese-like protein  100 
 
 		 288 aa  580  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  56.99 
 
 		 290 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1871  Rhodanese domain protein  47.32 
 
 		 342 aa  268  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  40.07 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  35.94 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  31.11 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  34.08 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  28.79 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  29.67 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  30.74 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  29.44 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  29.04 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.35 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.51 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  40.4 
 
 		 98 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 125 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  40.24 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  46.51 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  45.92 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  39.02 
 
 		 148 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 130 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  41.94 
 
 		 98 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  42.2 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  50.91 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  34.12 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 98 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 141 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.63 
 
 		 813 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  34.12 
 
 		 124 aa  63.9  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.39 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  43.68 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  35.51 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  42.17 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  37.04 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  44.44 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  36.9 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  37.66 
 
 		 476 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.46 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  37.23 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  33.62 
 
 		 133 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  44.3 
 
 		 98 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  44.3 
 
 		 98 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  44.3 
 
 		 98 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  44.3 
 
 		 98 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.24 
 
 		 132 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  38.96 
 
 		 103 aa  62  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 		 105 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  38.16 
 
 		 118 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  45.88 
 
 		 116 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  34.26 
 
 		 114 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 		 124 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.4 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 124 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 124 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  42.35 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  39.47 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.56 
 
 		 568 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.51 
 
 		 581 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2188  Rhodanese domain protein  43.16 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0415469  hitchhiker  0.000000235552 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  40.45 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2558  rhodanese-like domain protein  43.16 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.029677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  31.82 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  42.86 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  41.77 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  42.5 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  41.18 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.3 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  31 
 
 		 100 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  45.98 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.36 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 		 129 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>