More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4423 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  100 
 
 		 116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  69.57 
 
 		 116 aa  167  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  55.56 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  50.89 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  48.7 
 
 		 109 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  48.21 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  51.85 
 
 		 110 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  50 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  52.25 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  45.54 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  48.65 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  44.35 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  47.41 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  44.35 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  53.26 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  51.65 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  41.82 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  47.75 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  47.56 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  41.74 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  43.56 
 
 		 105 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  44.12 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  45.56 
 
 		 108 aa  87  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  45.12 
 
 		 269 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  44.71 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  49.44 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  55.56 
 
 		 356 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.42 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  41.58 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  42.31 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  46.34 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  53.09 
 
 		 356 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  53.09 
 
 		 356 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  54.32 
 
 		 356 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.75 
 
 		 383 aa  80.1  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  53.09 
 
 		 356 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  43.12 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  43.53 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  51.85 
 
 		 356 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  44.71 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  51.85 
 
 		 356 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  45.33 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  39.56 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  40 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  40.95 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  45.68 
 
 		 471 aa  77  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.32 
 
 		 383 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.75 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  44.34 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  44.68 
 
 		 461 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0395  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  36.73 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  41.74 
 
 		 711 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  37.25 
 
 		 229 aa  73.9  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 478 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.31 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4871  rhodanese-like domain-containing protein  32.32 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  41.38 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  41.38 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  48.31 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  43.62 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  38.04 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4560  rhodanese domain-containing protein  32.32 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  48.1 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  45.88 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  42.5 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4841  rhodanese-like domain protein  32.32 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000626615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.67 
 
 		 478 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  44.05 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4865  rhodanese-like domain protein  33.68 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  41.76 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  43.24 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  40.45 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  40.45 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4479  rhodanese-like domain-containing protein  31.31 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0848615  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  41.98 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.5 
 
 		 478 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  32.29 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.5 
 
 		 478 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.25 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 484 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  32.29 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  32.29 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.44 
 
 		 548 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000142725  normal  0.651918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>