More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2962 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  296  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  78.08 
 
 		 269 aa  237  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  48.91 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  52.81 
 
 		 138 aa  103  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  50.53 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  50.53 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  55.29 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  48.48 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  42.42 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  39.84 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  48.91 
 
 		 116 aa  94  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  45 
 
 		 480 aa  93.6  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  45.65 
 
 		 220 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  45.26 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  35.97 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  48.08 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  39.52 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  46.24 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  41.18 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  44.23 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  45.16 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 		 130 aa  91.3  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  43.18 
 
 		 170 aa  90.9  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  50.6 
 
 		 113 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  40.82 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  40.19 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  44.94 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  46.88 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  51.76 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  45.26 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  40.59 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  47.78 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  50.63 
 
 		 189 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  42.71 
 
 		 114 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  44.32 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 		 357 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  45.16 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  50.63 
 
 		 279 aa  86.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  48.86 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  39.6 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  47.06 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  34.59 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  41 
 
 		 480 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  50 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 		 216 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 		 125 aa  84.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  46.15 
 
 		 189 aa  84.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  43.18 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  36.42 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  38.61 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  38.58 
 
 		 356 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  51.85 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  37.96 
 
 		 173 aa  84.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  50.65 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  49.35 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  42.22 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  46.34 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.44 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  46.34 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  45.1 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  48.28 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  46.34 
 
 		 356 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  43.68 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  40.22 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  45.45 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  42.16 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  47.56 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  39.39 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  48.78 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  40.37 
 
 		 470 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  43.88 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  47.31 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  38.38 
 
 		 471 aa  80.9  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  50 
 
 		 390 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 356 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  44.32 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  45.05 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  45.33 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  35.25 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  46.15 
 
 		 288 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.15 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  42.17 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  44.09 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  37.88 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  43.88 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>