More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1570 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 127 aa  253  6e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  46.39 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  48 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  44.33 
 
 		 220 aa  83.6  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  40.59 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  48.78 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1508  Rhodanese domain protein  48.05 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  35.14 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  32.5 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  45.88 
 
 		 216 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  47.06 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  43.42 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  50.67 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  36.36 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  37.89 
 
 		 565 aa  74.7  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  52.86 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  48.61 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  43.33 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 459 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  37.5 
 
 		 459 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 459 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  36.52 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.25 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.2 
 
 		 568 aa  71.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  46.99 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  36.56 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  41.86 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  47.5 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  41.03 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  48 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  45.68 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  40.96 
 
 		 470 aa  69.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  46.97 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  50 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  42.35 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  47.3 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  46.48 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0741  rhodanese-like domain-containing protein  40.85 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  42.31 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  40.85 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  39.19 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  44.78 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  44 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  43.06 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  42.25 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  42.31 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  30.83 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  40.85 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  40.85 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  40.85 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  45.07 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  39.74 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  39.74 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  36.96 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  39.74 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  46.27 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  46.97 
 
 		 459 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  46.97 
 
 		 459 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.63 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  42.5 
 
 		 201 aa  67  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  41.38 
 
 		 171 aa  67  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.35 
 
 		 817 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  46.67 
 
 		 820 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  41.33 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  39.76 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  32.11 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  43.37 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0541  hypothetical protein  30.93 
 
 		 598 aa  65.9  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.360191  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  44.16 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  40.85 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  41.77 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  49.25 
 
 		 464 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>