More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3449 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  350  5e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  40.99 
 
 
173 aa  124  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  42.74 
 
 
142 aa  89.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  37.19 
 
 
125 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  35.77 
 
 
127 aa  88.2  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  37.19 
 
 
123 aa  88.2  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.59 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  30.82 
 
 
129 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  36.97 
 
 
123 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.17 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 
129 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  35.85 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  33.1 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 
269 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  37.27 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.61 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  40.57 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 
103 aa  77  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  30.57 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  37.4 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.28 
 
 
392 aa  75.5  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.77 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2188  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0415469  hitchhiker  0.000000235552 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2558  rhodanese-like domain protein  34.43 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.029677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  33.33 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  31.25 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  30.72 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  33.9 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  31.09 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  31.09 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  36.04 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  32.03 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  34.21 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  37.25 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  37 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  36.61 
 
 
118 aa  72  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  33.88 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  28.67 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  32.79 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  36.61 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  32.77 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  28.67 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  29.58 
 
 
135 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.03 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  29.58 
 
 
135 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.17 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1579  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.26 
 
 
566 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  29.58 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  34.58 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  35.4 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  37.62 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  33.94 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  34.82 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  30.28 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  30.28 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  32.73 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
380 aa  68.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  30.28 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  30.28 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  30.28 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  36.45 
 
 
282 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  28.87 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  36.44 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  28.06 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  31.19 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  30.58 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  36.7 
 
 
277 aa  67.8  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.09 
 
 
390 aa  67.8  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  31.19 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  30.28 
 
 
119 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  30.28 
 
 
119 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  30.28 
 
 
119 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  35.65 
 
 
460 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  31.19 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  35.14 
 
 
129 aa  67  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 
469 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  29.84 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0741  rhodanese-like domain-containing protein  30.28 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  28.17 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  30.51 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  30.28 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  29.31 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.94 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  37.38 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  26.89 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  32.32 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 
476 aa  65.9  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  36.96 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  34.78 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.24 
 
 
568 aa  65.5  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  36.67 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>