More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2710 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  100 
 
 		 107 aa  224  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  76.64 
 
 		 107 aa  173  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  64.49 
 
 		 107 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  64.49 
 
 		 107 aa  144  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  64.49 
 
 		 107 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  61.68 
 
 		 107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  61.68 
 
 		 107 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  61.68 
 
 		 107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  61.82 
 
 		 110 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  61.82 
 
 		 110 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  60.75 
 
 		 107 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  60.75 
 
 		 107 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  60.75 
 
 		 107 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  61.82 
 
 		 110 aa  135  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  60.75 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  59.81 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  57.94 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  57.94 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  57.94 
 
 		 109 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  57.94 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  57.94 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  57.01 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  57.01 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  52.34 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  57.14 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  51.4 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  53.85 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  47.22 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  47.12 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  47.12 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  49.53 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  49.53 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  50.5 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  54.64 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  47.12 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  47.66 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.17 
 
 		 393 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  48.6 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  51.16 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  49.48 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.67 
 
 		 383 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  45.79 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.51 
 
 		 377 aa  91.3  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.12 
 
 		 375 aa  90.5  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  49.46 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  51.81 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.34 
 
 		 395 aa  84.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.31 
 
 		 383 aa  83.6  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  44.64 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.35 
 
 		 383 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  42.73 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  42.73 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  43.16 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  45.33 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  46.99 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16081  rhodanese-like protein  40 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  38.74 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  43.56 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  39.42 
 
 		 377 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  43.56 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  43.56 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  45.33 
 
 		 269 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  44.55 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  42.31 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.19 
 
 		 361 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  40.38 
 
 		 377 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  46.24 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  41.24 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  39 
 
 		 461 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  39.09 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  45.35 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  36.89 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  37.72 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2096  rhodanese-like protein  40 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.25 
 
 		 390 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  43.37 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.25 
 
 		 390 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  44.58 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  43.01 
 
 		 308 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4626  rhodanese-like domain-containing protein  34 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  34 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  37.62 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  34 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  34 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 460 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4479  rhodanese-like domain-containing protein  35.05 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0848615  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  36.11 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  40.51 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  46.05 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  48.21 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  43.59 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>