More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1253 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  56.6 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  35.86 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  44.83 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  41.86 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  39.6 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 220 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  44.09 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  38.14 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  43.96 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.96 
 
 		 386 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0082  Rhodanese domain protein  46.74 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  44.71 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  45.12 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.27 
 
 		 201 aa  63.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2558  rhodanese-like domain protein  36.27 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.029677  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2188  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0415469  hitchhiker  0.000000235552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.6 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  34.48 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  38.46 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  39.18 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  30.68 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.05 
 
 		 379 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.05 
 
 		 379 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  29.67 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  36.67 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1453  rhodanese domain-containing protein  43 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  38.71 
 
 		 423 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  31.69 
 
 		 247 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  38.75 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  38.75 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  38.75 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  38.75 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  38.75 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  31.82 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  38.75 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  30.68 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  38.75 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  38.75 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  27.41 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  34.09 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  38.75 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 		 389 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  30.16 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.35 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  29.32 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0755  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  41.49 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  33.72 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  30.68 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  32.18 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  37.11 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  30.85 
 
 		 685 aa  58.5  0.00000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  25.45 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  37.18 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  31.25 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  36.9 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  36.71 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  27.2 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.77 
 
 		 398 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>