More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0154 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
113 aa  233  9e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  56.6 
 
 
134 aa  133  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0112  rhodanese domain protein  60.58 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00002113  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  54.55 
 
 
124 aa  131  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  57 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  54.05 
 
 
138 aa  124  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  54.08 
 
 
132 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  56.84 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0533  rhodanese-like protein  50.46 
 
 
124 aa  117  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298777  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  44.94 
 
 
170 aa  90.5  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  45.88 
 
 
220 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  51.32 
 
 
102 aa  82  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  50 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  46.51 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  44.71 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  46.99 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 
145 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  40.66 
 
 
112 aa  76.6  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  44.71 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  45.78 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  42.35 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  43.53 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 
269 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  45.88 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  42.35 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 
103 aa  73.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  40.7 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  43.01 
 
 
216 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.99 
 
 
383 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  40.66 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  42.86 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  40.22 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  36.67 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  42.35 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  41.18 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  44.16 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  40.91 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  42.17 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  32.22 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  37.23 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  41.56 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  41.56 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  41.56 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  41.56 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  42.86 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  39.29 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  41.25 
 
 
356 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  41.25 
 
 
356 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.75 
 
 
357 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  41.25 
 
 
356 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  40 
 
 
356 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
356 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 
356 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  40 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  40.74 
 
 
390 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  36.78 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  38.71 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  41.25 
 
 
105 aa  62.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  40 
 
 
123 aa  62  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 
356 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  38.75 
 
 
357 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  40.24 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.48 
 
 
390 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  38.24 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  40.24 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.54 
 
 
348 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
185 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  40.43 
 
 
175 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.29 
 
 
390 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  34.15 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.65 
 
 
395 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0103  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  35.71 
 
 
565 aa  60.8  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.37 
 
 
392 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.29 
 
 
387 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.77 
 
 
390 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  39.08 
 
 
105 aa  60.1  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.5 
 
 
390 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.35 
 
 
383 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  39.02 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
226 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  37.35 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>