More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0714 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  100 
 
 		 138 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  60.58 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  58.7 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  55.88 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  55.15 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  54.41 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  54.41 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  55.47 
 
 		 128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  55.15 
 
 		 136 aa  141  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  55.15 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  49.26 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  49.29 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  47.86 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  47.45 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  41.91 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  44.44 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  43.07 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  44.29 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  42.34 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  43.48 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  41.61 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  41.61 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  42.75 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  47.86 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.75 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  40.88 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  40.88 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  40.88 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  40.88 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  40.88 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  41.04 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  41.04 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  41.04 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  39.86 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  42.14 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  42.14 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  41.43 
 
 		 140 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  41.43 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  41.43 
 
 		 140 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  37.96 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  35.29 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  35.29 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  36.59 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  35.78 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  32.12 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  34.53 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  28.15 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  32.77 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  31.93 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  32.84 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  31.11 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  34.65 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 269 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  32.69 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  39.32 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  32.12 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  33.65 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  30.15 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  34.65 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  35.54 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  35.54 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  35.54 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  41.3 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  35.54 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  35.54 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.71 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  35.54 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  35.54 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  43.43 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  37.84 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  31.45 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  33.88 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  36.84 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  31.62 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1947  rhodanese domain-containing protein  30.71 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  44.3 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  34.51 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  33.88 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  44.3 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  29.17 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.35 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  33 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  31.07 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>