More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3612 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  100 
 
 		 141 aa  290  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  63.83 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  51.06 
 
 		 141 aa  153  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  44.68 
 
 		 143 aa  131  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  44.68 
 
 		 143 aa  131  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 		 143 aa  131  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 		 143 aa  131  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  44.68 
 
 		 143 aa  131  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  41.84 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  43.97 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  43.97 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  43.97 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  42.75 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  42.55 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  43.97 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  43.97 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  40.43 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  43.97 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  43.97 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  43.97 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  40.43 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  40.43 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  43.26 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  45.39 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  43.26 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  41.84 
 
 		 144 aa  126  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  43.26 
 
 		 144 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  43.26 
 
 		 143 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  42.55 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  42.55 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  42.55 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  42.55 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0178  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  42.55 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  41.84 
 
 		 143 aa  123  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  41.13 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  43.97 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  42.55 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 		 170 aa  120  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 143 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  40.43 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  42.55 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  43.55 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  42.55 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  42.55 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  38.3 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  41.84 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  41.84 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0174  rhodanese domain-containing protein  31.65 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  45.32 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.88 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  38.73 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  38.73 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  40.43 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  40.71 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  36.17 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  36.17 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  37.06 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  40 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  40.29 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  36.96 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  35.04 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  32.62 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0410  rhodanese domain-containing protein  38.85 
 
 		 137 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.692094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  38.13 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  34.75 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  43.26 
 
 		 139 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  43.26 
 
 		 139 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  31.21 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  35.04 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  32.85 
 
 		 161 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  29.79 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  38.13 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04680  Rhodanese-like protein  42.45 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.940144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  38.13 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.09 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  32.62 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  31.65 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  32.37 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  32.37 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  32.37 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  32.37 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  32.28 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  34.31 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  33.07 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  35.16 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  32.28 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  32.28 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  38.32 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  32.28 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  33.09 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  32.28 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>