More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0210 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 140 aa  276  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  94.29 
 
 		 140 aa  261  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  90 
 
 		 151 aa  251  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  70 
 
 		 137 aa  191  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  58.57 
 
 		 161 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  56.43 
 
 		 141 aa  166  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  58.57 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  58.57 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  58.57 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  58.57 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  58.57 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  58.57 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  55.71 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  58.57 
 
 		 135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  58.57 
 
 		 135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  59.29 
 
 		 140 aa  159  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  57.86 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  57.14 
 
 		 140 aa  156  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  57.14 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  56.43 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  56.43 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  56.43 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  47.14 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  45.52 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  53.85 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  45 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  42.14 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  47.86 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  45.71 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  44.6 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  47.86 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  44.6 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 		 135 aa  113  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  47.73 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  51.43 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  46.43 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  43.57 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  38.57 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  42.54 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  47.14 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  44.79 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1947  rhodanese domain-containing protein  38.57 
 
 		 137 aa  96.7  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  41.54 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  43.14 
 
 		 170 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  35.46 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  35.25 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  36.43 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  35.46 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  36.43 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  34.04 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  46.51 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  32.86 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  40.62 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 144 aa  83.6  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  38.95 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  40.62 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  33.83 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  38.54 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  39.22 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  46.39 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 		 269 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  45.24 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  36.43 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  39.22 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  38.54 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  36.44 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  44.05 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  40.78 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  30.22 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  39.81 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  32.2 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  37.3 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  32.5 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  37.86 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  39.42 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  42.5 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  39.6 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  41.25 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  41.25 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  41.25 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  41.25 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>