More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002246 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 
144 aa  294  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  93.06 
 
 
144 aa  277  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  78.47 
 
 
144 aa  244  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  67.86 
 
 
145 aa  206  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  49.65 
 
 
143 aa  155  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  51.75 
 
 
143 aa  154  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  48.95 
 
 
144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  48.95 
 
 
144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  48.95 
 
 
144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  51.75 
 
 
143 aa  153  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  51.75 
 
 
143 aa  153  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  51.75 
 
 
143 aa  153  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  51.75 
 
 
143 aa  153  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  51.75 
 
 
143 aa  153  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  50.35 
 
 
143 aa  152  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  48.61 
 
 
144 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  50.35 
 
 
143 aa  150  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  50.35 
 
 
143 aa  150  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  50.35 
 
 
143 aa  150  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  50.35 
 
 
143 aa  150  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  50.35 
 
 
143 aa  150  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  50.35 
 
 
143 aa  150  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  50.35 
 
 
143 aa  150  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  50.35 
 
 
143 aa  150  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  48.25 
 
 
143 aa  150  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  49.65 
 
 
143 aa  150  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  47.55 
 
 
144 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  47.92 
 
 
144 aa  148  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 
170 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0178  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 
143 aa  142  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
144 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 
158 aa  139  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 
144 aa  137  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 
144 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  43.92 
 
 
148 aa  135  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  43.26 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  45.67 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0174  rhodanese domain-containing protein  41.26 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  36.88 
 
 
142 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  39.01 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  42.55 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  37.76 
 
 
144 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  34.75 
 
 
141 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  37.67 
 
 
145 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  40.85 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  42.34 
 
 
137 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  34.97 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  34.97 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  35.46 
 
 
151 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  41 
 
 
140 aa  87.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  33.8 
 
 
141 aa  87  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  33.8 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  34.75 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  34.25 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  42.71 
 
 
140 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  37.32 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  39.42 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  32.87 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  32.87 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  32.35 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  32.35 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.94 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  31.37 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  32.35 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  32.35 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  31.37 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  31.37 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  27.74 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  31.37 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  31.37 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  31.37 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  37.59 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  32.86 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  31.39 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  37.5 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  30.08 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  30.08 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  29.41 
 
 
149 aa  76.6  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  32.14 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  27.74 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  35.46 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  34.65 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>