More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0305 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  100 
 
 
137 aa  270  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  70 
 
 
151 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  67.14 
 
 
140 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  70 
 
 
140 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  57.66 
 
 
135 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  57.66 
 
 
135 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  57.66 
 
 
135 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  56.93 
 
 
135 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  56.93 
 
 
135 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  56.93 
 
 
135 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  56.93 
 
 
135 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  56.93 
 
 
135 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  54.74 
 
 
140 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  54.74 
 
 
140 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  54.74 
 
 
140 aa  155  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  54.01 
 
 
140 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  53.28 
 
 
140 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  53.28 
 
 
140 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  52.9 
 
 
141 aa  154  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  53.28 
 
 
140 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  52.17 
 
 
141 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  52.9 
 
 
161 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  48.09 
 
 
141 aa  120  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  50.39 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  47.45 
 
 
138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  46.03 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  43.8 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  44.19 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  43.8 
 
 
136 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  42.34 
 
 
140 aa  104  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  40.58 
 
 
138 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  40.88 
 
 
137 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  45.26 
 
 
135 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  39.42 
 
 
135 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  40.88 
 
 
135 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  40.88 
 
 
135 aa  100  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  40.88 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
141 aa  96.7  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  42.86 
 
 
141 aa  96.7  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1947  rhodanese domain-containing protein  40.88 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  45.99 
 
 
135 aa  90.9  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  35.04 
 
 
138 aa  90.1  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  34.78 
 
 
145 aa  84.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  34.51 
 
 
144 aa  83.6  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  35.66 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  35.66 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  41.35 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  40 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  38.83 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  39.09 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  31.85 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  40.2 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  35.38 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  42.31 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  39.42 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  40.2 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  32.76 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  37.5 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  40.95 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  37.5 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  37.5 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  37.5 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  42.16 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  36.15 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  31.62 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  40.95 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  40.95 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  35.14 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  30.37 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  42.57 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 
158 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  32.86 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  34.21 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  39.42 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  36.54 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 
269 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  35.58 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  35.58 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  35.58 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  35.58 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>