More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1392 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
120 aa  246  8e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  53.57 
 
 
118 aa  130  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  59.8 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  50.49 
 
 
108 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  52 
 
 
108 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  50 
 
 
108 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  49.49 
 
 
107 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  47.52 
 
 
108 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  46.36 
 
 
175 aa  97.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  47.47 
 
 
111 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  47.06 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  46 
 
 
185 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  44.55 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  52.63 
 
 
113 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  45.79 
 
 
107 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  45.79 
 
 
107 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  43.56 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  45.79 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  45.1 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
220 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  40.57 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  46.94 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.43 
 
 
390 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  38.83 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  42.57 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  41.58 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.12 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5070  rhodanese domain-containing protein  42.42 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.34245  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  39.22 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  45.36 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.9 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  43.9 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  50 
 
 
398 aa  67.8  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  34.55 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  42.57 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  38 
 
 
320 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  35.87 
 
 
484 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.87 
 
 
478 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.87 
 
 
478 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  35.87 
 
 
478 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  37.25 
 
 
361 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  35.87 
 
 
484 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.15 
 
 
386 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.87 
 
 
478 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  32.52 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.67 
 
 
392 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  39.76 
 
 
377 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  44.3 
 
 
393 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.24 
 
 
393 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 
178 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  36.7 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.6 
 
 
392 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  43.01 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.434015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  34.68 
 
 
277 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  35.64 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  37 
 
 
476 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
269 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.15 
 
 
399 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  42.35 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  41.67 
 
 
386 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  42.31 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40 
 
 
392 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.78 
 
 
478 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  35.92 
 
 
122 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 
119 aa  60.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.11 
 
 
395 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  39.39 
 
 
178 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  46.15 
 
 
390 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.96 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.83 
 
 
400 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1907  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.56 
 
 
364 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107566  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  37 
 
 
271 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.83 
 
 
400 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.83 
 
 
400 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 
197 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  34.58 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
138 aa  58.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  43.53 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  39.08 
 
 
201 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  43.53 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  42.5 
 
 
393 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>