More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0755 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0755  Rhodanese domain protein  100 
 
 
154 aa  306  9e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4501  hypothetical protein  45.33 
 
 
184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4199  rhodanese-like protein  54.55 
 
 
141 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4426  rhodanese domain-containing protein  54.55 
 
 
141 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338924  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4265  rhodanese domain-containing protein  54.55 
 
 
141 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24925  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 
220 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.27 
 
 
389 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  32.1 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.4 
 
 
395 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 
102 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.9 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  35.11 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  35.29 
 
 
170 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  32.43 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  36.56 
 
 
118 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  46.81 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  29.86 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.29 
 
 
834 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  33.72 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  30.26 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33 
 
 
393 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  36.17 
 
 
109 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  38.81 
 
 
144 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 
130 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.03 
 
 
123 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.95 
 
 
388 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  26.06 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  27.27 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  28.78 
 
 
229 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  30.21 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  36.07 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  36.07 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  36.07 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  36.07 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  36.07 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  30.95 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  31.51 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  36.07 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  31.51 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0733  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  33.33 
 
 
247 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168606  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  31.51 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  31.51 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  27.62 
 
 
820 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  28.24 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  32.47 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  36.84 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  31.51 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 
476 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  31.51 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  29.46 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  31.51 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  31.51 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  29.7 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  29.46 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  29.81 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  32.43 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  34.92 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  34.12 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  30.67 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  34.92 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  30.85 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  30.59 
 
 
269 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  29.91 
 
 
323 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  31.08 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30.67 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  26.17 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  30.67 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  31.82 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  30.69 
 
 
356 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  27.1 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  35.23 
 
 
119 aa  48.5  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2517  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal  0.344118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  28.18 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  30.85 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  36.49 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 
119 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  30.51 
 
 
122 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  32.89 
 
 
177 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  25.45 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  31.17 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>