More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3559 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  100 
 
 		 229 aa  474  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2519  Rhodanese domain protein  32.37 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  34.39 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4649  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  45.05 
 
 		 106 aa  95.9  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  40 
 
 		 98 aa  94.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  39 
 
 		 108 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  41.57 
 
 		 127 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  40.91 
 
 		 108 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  40.22 
 
 		 98 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  43.12 
 
 		 123 aa  90.5  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  37.36 
 
 		 109 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  42.05 
 
 		 108 aa  90.1  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  46.91 
 
 		 104 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  42.35 
 
 		 107 aa  89  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  43.33 
 
 		 108 aa  88.6  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  42.39 
 
 		 114 aa  88.2  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  46.74 
 
 		 107 aa  88.2  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  44.44 
 
 		 105 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  41.57 
 
 		 107 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  43.18 
 
 		 116 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  42.68 
 
 		 110 aa  87  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  38.89 
 
 		 112 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  41.57 
 
 		 111 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  42.35 
 
 		 107 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  44.44 
 
 		 107 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  43.62 
 
 		 108 aa  86.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  42.22 
 
 		 112 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  40.21 
 
 		 108 aa  85.9  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  39.8 
 
 		 107 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  43.02 
 
 		 107 aa  85.5  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0945  thioredoxin domain-containing protein  40.82 
 
 		 109 aa  85.5  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  40.66 
 
 		 110 aa  85.1  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  43.18 
 
 		 110 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  37.76 
 
 		 106 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  38.2 
 
 		 107 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  37.72 
 
 		 127 aa  84.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  38.14 
 
 		 105 aa  84.7  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  38.46 
 
 		 102 aa  84.3  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  38.2 
 
 		 107 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  37.5 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  34.51 
 
 		 148 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  39.13 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  40.43 
 
 		 106 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  40 
 
 		 98 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  35.85 
 
 		 109 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  41.11 
 
 		 109 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  41.11 
 
 		 109 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  38.2 
 
 		 107 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  41.11 
 
 		 109 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  36.89 
 
 		 108 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  34.86 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  40.22 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  41.67 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  44.71 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  39.33 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  40.22 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  39.13 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  41.67 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  40.24 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  39.13 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  39.13 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  38.46 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  35.42 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  39.77 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  37.25 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  38.1 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  35.8 
 
 		 102 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  36.08 
 
 		 105 aa  80.9  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  37.5 
 
 		 106 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  34.38 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  36.36 
 
 		 110 aa  80.9  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  35.42 
 
 		 106 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  35.05 
 
 		 106 aa  81.3  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  34.04 
 
 		 110 aa  80.9  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  34.34 
 
 		 108 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  38.14 
 
 		 109 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  41.18 
 
 		 107 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  37.5 
 
 		 110 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  38.14 
 
 		 109 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  39.78 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  38.1 
 
 		 119 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  35.19 
 
 		 108 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  36.67 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  39.36 
 
 		 105 aa  80.5  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  37.21 
 
 		 108 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  37.78 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  36.67 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>