More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0487 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 134 aa  275  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  54.84 
 
 		 124 aa  158  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0112  rhodanese domain protein  63.46 
 
 		 104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00002113  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  47.11 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0533  rhodanese-like protein  55.88 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298777  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  56.6 
 
 		 113 aa  133  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  52.73 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  51.35 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  50.48 
 
 		 132 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  42.31 
 
 		 170 aa  98.2  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.35 
 
 		 220 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  42.06 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  43.14 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  41.86 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 269 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  34.91 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  33.96 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  35.85 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  38.38 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  40.21 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  35.24 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  37.89 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  40.57 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  37.78 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 		 185 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  37.61 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  33.98 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  31.67 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  34.95 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  37.78 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  36.47 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  30.48 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.41 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.73 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0103  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  31.58 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.29 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.66 
 
 		 567 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.92 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4642  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.845465  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 476 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.9 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  35.24 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 		 356 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.02 
 
 		 379 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  33.72 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.02 
 
 		 386 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.02 
 
 		 393 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  37.97 
 
 		 356 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  37.86 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 		 356 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  35.37 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  38.1 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  38.1 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 393 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  37.97 
 
 		 356 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 		 356 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  29.9 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  36.71 
 
 		 356 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  26.77 
 
 		 170 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  38.1 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  38.46 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.51 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5503  Rhodanese domain protein  29.37 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.91 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>