More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0775 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 124 aa  255  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  54.84 
 
 		 134 aa  158  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  51.28 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  54.55 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0112  rhodanese domain protein  51.92 
 
 		 104 aa  124  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00002113  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0533  rhodanese-like protein  50.81 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298777  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  48.6 
 
 		 132 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  46.36 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  45.05 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39.42 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  37.74 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  44.71 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  39.22 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  33.93 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  36.11 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  36.54 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  32.14 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  40.66 
 
 		 269 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  37.61 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0103  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  39.18 
 
 		 565 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.68 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  33.96 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  41.38 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  37.4 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  37.4 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  36.21 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  36.19 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  34.31 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  35.92 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  39.58 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 277 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.03 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  34.62 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  38.14 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  33.98 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 478 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  34.62 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  31.78 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  40 
 
 		 356 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 		 356 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.86 
 
 		 387 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.74 
 
 		 383 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  37.65 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  29.81 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  40 
 
 		 356 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 356 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.98 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  33.91 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  40.48 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  39.74 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  37.21 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4642  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.845465  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  33.94 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  38.96 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  37.37 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.36 
 
 		 390 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.65 
 
 		 478 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 480 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  36.14 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  34.74 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.55 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  37.33 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  30.09 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  40.54 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>