More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5503 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5503  Rhodanese domain protein  100 
 
 
146 aa  300  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0624  Rhodanese domain protein  37.4 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3859  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3644  Rhodanese domain protein  37.01 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3209  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  40.82 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  38.54 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0757  rhodanese domain-containing protein  38.21 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  0.496229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0117  rhodanese-like protein  35.66 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  38.1 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  32.8 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0151  rhodanese-like domain protein  34.38 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2626  rhodanese-like protein  34.65 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  40.86 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0322  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.089082 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  33.06 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0086  rhodanese-like protein  36.22 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0195  rhodanese-like domain-containing protein  34.43 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  34.43 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0929  rhodanese-like domain-containing protein  34.43 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0452  rhodanese-like domain-containing protein  34.43 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.401061  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0366  rhodanese-like domain-containing protein  34.43 
 
 
155 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1822  rhodanese domain-containing protein  34.43 
 
 
155 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  33.98 
 
 
116 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1909  rhodanese/Cdc25 fold  34.43 
 
 
155 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.636231  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 
151 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.47 
 
 
393 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  41.3 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  30.65 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  42.05 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  32.41 
 
 
194 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0027  hypothetical protein  36.8 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.335991  normal  0.134752 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.5 
 
 
220 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  31.2 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 
216 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  39.02 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  30.4 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2329  Rhodanese domain protein  32.59 
 
 
197 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3127  hypothetical protein  28.03 
 
 
207 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154894  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2287  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
209 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  34.62 
 
 
116 aa  57  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2063  rhodanese-like protein  35.94 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
463 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1482  hypothetical protein  36.43 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  35.64 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  29.37 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3513  rhodanese domain-containing protein  35.38 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4005  rhodanese domain-containing protein  35.38 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816307  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  40 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  35.43 
 
 
120 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  33.7 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  33.7 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  33.7 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  33.7 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  26.83 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  33.7 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  33.7 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3551  hypothetical protein  34.38 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502988 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  27.13 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  40.66 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  40.66 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  33.7 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  36.63 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  30.36 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 
471 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  29.69 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  35.23 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.43 
 
 
388 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  28.57 
 
 
130 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0048  rhodanese-like protein  34.85 
 
 
132 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0235  rhodanese-like protein  33.07 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.661399  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  41.05 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  33.9 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  32.61 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0538  rhodanese domain-containing protein  37.1 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 
171 aa  53.5  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 
131 aa  53.5  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  28 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>