More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0322 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0322  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 132 aa  276  7e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.089082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0151  rhodanese-like domain protein  100 
 
 		 132 aa  276  7e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0235  rhodanese-like protein  61.11 
 
 		 128 aa  179  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.661399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0117  rhodanese-like protein  58.27 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0086  rhodanese-like protein  54.33 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2535  Rhodanese domain protein  53.33 
 
 		 143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.607232  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0171  rhodanese-like protein  52.34 
 
 		 145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1742  Rhodanese domain protein  51.47 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.354198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0157  Rhodanese domain protein  55.56 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0150  Rhodanese domain protein  54.33 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0296  hypothetical protein  56.35 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0048  rhodanese-like protein  51.18 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3209  rhodanese domain-containing protein  48 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2626  rhodanese-like protein  42.4 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0002  rhodanese domain-containing protein  42.54 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000108771  hitchhiker  1.00132e-23 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2139  rhodanese-like protein  45.08 
 
 		 176 aa  103  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109425  decreased coverage  0.0000830085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1556  hypothetical protein  43.2 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0120  rhodanese-like domain-containing protein  44.8 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4005  rhodanese domain-containing protein  42.4 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816307  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3513  rhodanese domain-containing protein  42.4 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0929  rhodanese-like domain-containing protein  42.4 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0195  rhodanese-like domain-containing protein  42.4 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  42.4 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0452  rhodanese-like domain-containing protein  42.4 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.401061  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0366  rhodanese-like domain-containing protein  42.4 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1909  rhodanese/Cdc25 fold  42.4 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.636231  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1822  rhodanese domain-containing protein  42.4 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0624  Rhodanese domain protein  39.52 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3765  rhodanese-like protein  38.71 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0703444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2167  rhodanese domain-containing protein  42.4 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.548621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3646  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0757  rhodanese domain-containing protein  39.2 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  0.496229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1293  rhodanese domain-containing protein  39.2 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1490  rhodanese domain-containing protein  40.3 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3613  rhodanese-like protein  40.8 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4035  Rhodanese domain protein  39.39 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0538  rhodanese domain-containing protein  44.14 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0027  hypothetical protein  39.2 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.335991  normal  0.134752 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2063  rhodanese-like protein  38.1 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4049  rhodanese-like protein  38.84 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0657384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2446  rhodanese-like protein  39.84 
 
 		 171 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000105937  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2287  rhodanese-like protein  37.9 
 
 		 209 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20970  Rhodanese-like protein  40.8 
 
 		 174 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00660232  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4172  rhodanese domain-containing protein  38.4 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0535  Rhodanese domain protein  37.12 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2616  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 154 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00605824  normal  0.758764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10394  hypothetical protein  38.97 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3516  rhodanese domain-containing protein  37.69 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3372  rhodanese-related sulfurtransferase  38.89 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1890  Rhodanese domain protein  38.76 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1482  hypothetical protein  35.71 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1520  hypothetical protein  35.71 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000699946  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2059  rhodanese-like protein  36.51 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1274  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0733136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0532  rhodanese domain-containing protein  36.8 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210744  normal  0.0949792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0687  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0548  Rhodanese domain protein  36.8 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1121  rhodanese domain-containing protein  36.51 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.461947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0515  rhodanese domain-containing protein  38.35 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4949  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2946  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0537  rhodanese domain-containing protein  38.35 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0661648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0525  rhodanese-like protein  38.35 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3477  Rhodanese domain protein  38.52 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5788  rhodanese domain-containing protein  39.68 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0512  Rhodanese domain protein  35.82 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00637526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3127  hypothetical protein  34.44 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2060  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1843  rhodanese-like domain-containing protein  34.92 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35020  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.35 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2187  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.992479  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5927  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2150  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2168  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784132 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3066  hypothetical protein  34.13 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43904  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1744  hypothetical protein  34.13 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.260357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2771  rhodanese-like protein  34.13 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5459  rhodanese-like protein  32.54 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2254  hypothetical protein  34.13 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1525  hypothetical protein  34.13 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0220  rhodanese domain-containing protein  37.59 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2692  hypothetical protein  34.13 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.340906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2636  hypothetical protein  34.13 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1085  Rhodanese domain protein  36.51 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1177  Rhodanese domain protein  36.51 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0955  rhodanese-like protein  34.23 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0394414  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1257  hypothetical protein  35.43 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.737183 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2392  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2329  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 197 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3859  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3644  Rhodanese domain protein  35.61 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3551  hypothetical protein  33.77 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3119  Rhodanese domain protein  30.83 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5503  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1529  rhodanese-like protein  28.37 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155027  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  43.3 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0373  rhodanese-like  29.53 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.370743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  32 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  40 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>