More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0050 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  296  8e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  98.61 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  97.22 
 
 		 158 aa  289  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  97.22 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  91.67 
 
 		 144 aa  278  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  90.28 
 
 		 149 aa  253  9e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  89.58 
 
 		 149 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  89.58 
 
 		 149 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  89.58 
 
 		 144 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  77.08 
 
 		 144 aa  240  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  71.53 
 
 		 170 aa  227  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  72.22 
 
 		 144 aa  226  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  71.53 
 
 		 144 aa  224  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  67.36 
 
 		 144 aa  216  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  66.67 
 
 		 144 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  65.12 
 
 		 130 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  47.55 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  44.44 
 
 		 144 aa  147  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  44.76 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0178  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 143 aa  141  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  42.57 
 
 		 148 aa  140  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  43.06 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  44.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  44.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  44.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  44.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  44.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  44.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  44.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  43.36 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  43.36 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  43.36 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  41.67 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  43.36 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  42.66 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  43.36 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  43.36 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  43.36 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  43.36 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  43.36 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  43.97 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  40.43 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0174  rhodanese domain-containing protein  39.86 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  42.55 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  39.29 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  38.3 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  38.73 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  39.01 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.64 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  39.17 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  36.81 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  35.92 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.81 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  35.21 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  35.21 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.81 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  32.62 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  34.97 
 
 		 146 aa  93.6  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  34.97 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  34.97 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  26.95 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  35.59 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 135 aa  84.3  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  32.86 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1736  rhodanese-like protein  34.04 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138343  normal  0.316919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  38.78 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  32.62 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  42.31 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  33.57 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  42.31 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  36.27 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  34.92 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  32.61 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0809  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.321585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  39.42 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  31.21 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  31.21 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  30.5 
 
 		 135 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  30.5 
 
 		 135 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  30.5 
 
 		 135 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  33.09 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  30.5 
 
 		 135 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  31.21 
 
 		 140 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  30.5 
 
 		 135 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  31.21 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  30.5 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>