More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2090 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  100 
 
 
137 aa  283  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  44.04 
 
 
148 aa  97.8  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  45.61 
 
 
144 aa  97.1  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
148 aa  94  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  43.27 
 
 
152 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  37.25 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  31.65 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.61 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  36.97 
 
 
131 aa  77  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  32.54 
 
 
129 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.68 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  39.81 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  30.95 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.9 
 
 
478 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  46.84 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 
480 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  31.2 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 
480 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  30.97 
 
 
685 aa  72.8  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  39.53 
 
 
389 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  36.44 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  45.07 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 
471 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  35.24 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  33.66 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.46 
 
 
478 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  33.1 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  40.38 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  37.27 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  40.24 
 
 
484 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.24 
 
 
478 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.24 
 
 
478 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  40.24 
 
 
478 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  40.24 
 
 
484 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  41.3 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  39.02 
 
 
478 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  28.93 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  39.76 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 
147 aa  67  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  38.82 
 
 
222 aa  67.4  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
269 aa  67  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.24 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  34.75 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 
102 aa  67  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  34.75 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  34.75 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  34.75 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  50.7 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  33.67 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  50.7 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  34.75 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  34.75 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  29.23 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  31.36 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  33.62 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  38.3 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  26.8 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  33.96 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.13 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  41.56 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.13 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  34.68 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.78 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  36.96 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  36.17 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 
470 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  28.35 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  32.43 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  43.02 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  31.87 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>