More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2777 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  284  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  93.48 
 
 		 138 aa  246  9e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  93.48 
 
 		 138 aa  244  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  89.51 
 
 		 143 aa  239  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  88.24 
 
 		 132 aa  187  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  70.68 
 
 		 132 aa  187  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  87.25 
 
 		 132 aa  184  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  87.25 
 
 		 132 aa  184  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  65.18 
 
 		 112 aa  159  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  56.78 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  59.43 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  54.55 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  55.28 
 
 		 132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  53.33 
 
 		 125 aa  130  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  58.16 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  58.24 
 
 		 136 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  47.96 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  46.32 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  43.81 
 
 		 116 aa  94  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  41.44 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  51.22 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  43.84 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  45.95 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  51.52 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  44.59 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  44.59 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  39.13 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  46.05 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  35.92 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  38.27 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  39.81 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  30.51 
 
 		 127 aa  66.6  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 101 aa  66.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.31 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  42.17 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  45.07 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  40.85 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  44.59 
 
 		 565 aa  64.7  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  42.25 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  40.96 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  41.79 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  43.66 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  47.69 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  40.28 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  39.73 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  44.59 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 		 470 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  43.48 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1398  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.27 
 
 		 554 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00125379  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  44.44 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  36.78 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  37.84 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  37.84 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.84 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.84 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.84 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.84 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  40.26 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  37.84 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.84 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.84 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2591  rhodanese-like domain-containing protein  36.49 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.459858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  48.33 
 
 		 464 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0364  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.82 
 
 		 568 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  34.04 
 
 		 182 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.95 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  35.4 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0155  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.74 
 
 		 575 aa  59.3  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.744088 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  30.47 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  40.24 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  40 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  37.36 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.17 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>