More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2117 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 116 aa  240  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  41.75 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  40.2 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  44.33 
 
 		 282 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  37.25 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  36.04 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  43.9 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  42.68 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  45.12 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  41.9 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.18 
 
 		 478 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  36.54 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  39.81 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 		 470 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.94 
 
 		 813 aa  74.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  42.05 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.05 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.05 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  42.05 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  42.05 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  35.24 
 
 		 685 aa  73.2  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  40.95 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  34.21 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.71 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  42.17 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.04 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  39.33 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  47.06 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  35.14 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.68 
 
 		 478 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  32.41 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  45.65 
 
 		 194 aa  70.1  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 480 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  40.66 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  40.26 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  34.52 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  39.09 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 		 220 aa  67  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  34.52 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1915  Rhodanese domain protein  51.85 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.697254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  37.25 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.78 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  30.1 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  37.14 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  36.04 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  36.27 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.48 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.42 
 
 		 938 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.79 
 
 		 383 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.02 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.71 
 
 		 361 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  44.3 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 		 480 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  40.24 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  39.76 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  38.75 
 
 		 288 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  43.9 
 
 		 356 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  39.58 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  32.74 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  30.93 
 
 		 272 aa  63.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  33.72 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  36.08 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>