More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1837 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  298  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  88 
 
 		 150 aa  247  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  44.21 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  39.22 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  46.39 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  46.39 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.61 
 
 		 395 aa  84.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  41.05 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  47.56 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  41.49 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  43.33 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  35.11 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  35.25 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  40.4 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.54 
 
 		 383 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  39.05 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  41.12 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  41.05 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  40.7 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  38.38 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  40.82 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  33.56 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.82 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  37.8 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  30.82 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  40.18 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.13 
 
 		 392 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.82 
 
 		 390 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  29.73 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  41.38 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 220 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  37.37 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  42.67 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  36.11 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  32.82 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  37.89 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  30.1 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.78 
 
 		 375 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2591  rhodanese-like domain-containing protein  40.96 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.459858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  37.89 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  30.85 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 		 279 aa  70.5  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  36.84 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 278 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  37.78 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  36.71 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  45.31 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  36.71 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  45.31 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  44.74 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  38.3 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  45.59 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  39 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  39.18 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.16 
 
 		 550 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  31.71 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  31.71 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  31.71 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  31.71 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  31.71 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  31.71 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  36.14 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  31.71 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  32.14 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.82 
 
 		 392 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  30.49 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0178  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>